Верхний блок с серым фоном так и хочется сделать с отступом от меню, а потом убрать серый фон у шапки, а потом еще и меню сделать не притянутым к краям. По моему лучше бы было

серый блок под навигацией полный разброд и шатания

отлично, но после верхнего меню чуток побольше отступа и будет вообще куль

Хорошо, насчет воздуха согласен, либо ставить меньше его при фильре выбора, либо увеличивать по всему сайту.
Думаю первое проще))